医院的资金流动涉及复杂的财务体系，其收入来源主要包括诊疗服务费、药品与耗材销售、政府财政拨款以及社会捐赠等四个渠道。根据医疗机构性质不同，公立医院与民营医院的资金管理模式存在显著差异。
在公立医院体系中，门诊与住院收入需全额上缴地方财政专户，实行收支两条线管理。具体流程为：收费窗口每日将现金收入存入指定监管账户，财务部门按月汇总编制《医疗收入缴款明细表》，经卫生主管部门审核后，资金进入国库集中支付系统。这种管理模式确保了公共医疗资金的全程监管，但也存在资金回拨周期较长的问题。
药品零差价政策实施后，医院药房转变为成本中心，药品采购款通过省级集中采购平台统一结算。医疗器械与设备更新资金需提前编制年度预算，经医院党委会审议后报卫健委审批。值得注意的是，大型医疗设备的购置还需进行可行性论证，包括使用率预测和成本回收周期计算。
医院支出结构包含刚性支出与弹性支出两大类别。人员经费约占总支出的35%-45%，包含基本工资、绩效奖金及五险一金。后勤保障支出涵盖水电暖供应、医疗废物处理等日常运维成本，通常占总支出18%-22%。学科建设基金按业务收入的3%-5%计提，用于科研项目与人才培养。
资金监管方面实行三级审计制度：院内审计部门每月核查原始凭证，第三方会计师事务所进行年度财务审计，审计机关不定期开展专项检查。医保资金的结算具有特殊性，实行\\"预付制\\"与\\"后付制\\"相结合的模式，DRG付费改革后，医院需要建立精细化的成本核算体系。
民营医院的资金管理相对灵活，但同样受到严格监管。营利性医院的税后利润分配需符合《医疗机构管理条例》要求，提取法定公积金后的剩余利润，股东分红比例不得超过可分配利润的50%。部分高端民营医院会设立医疗风险基金，按业务收入的1%-2%计提，用于处理医疗纠纷赔偿。
医院的固定资产管理遵循《事业单位财务规则》，医疗设备折旧年限按类别划分：电子类设备5-8年，机械类设备10-15年。房屋建筑物折旧资金单独核算，专项用于院区改扩建工程。近年来推行的智慧医院建设，其资金来源多采用PPP模式，由医院与社会资本共同出资。
财务公开制度要求二级以上医院每年发布经审计的财务报告，披露收入构成、支出明细、资产负债等重要信息。患者可以通过医院官网或财务公示栏查询具体数据，卫生行政主管部门也会定期公布区域医疗机构的财务运行分析报告。
